Khởi đầu sự nghiệp

Afellay bắt đầu sự nghiệp bóng đá của anh tại câu lạc bộ USV Elinkwijk ở Utrecht.

PSV Eindhoven

Năm 1996 Afellay chuyển sang học viện đào tạo trẻ của PSV Eindhoven. Lần xuất hiện chính thức của Afellay cho PSV Eindhoven là vào ngày 4 tháng 2 năm 2004 trong trận đấu cúp gặp NAC Breda khi anh mới 17 tuổi. Ngày 14 tháng 2,anh có trận đấu đầu tiên tại giải Eredivisie gặp câu lạc bộ Twente. Anh đã có 3 trận thi đấu chính thức trong mùa giải 2003–04, và hơn 7 trận ở mùa giải 2004–05.

Ngày 15 tháng 5 năm 2005, trong trận PSV Eindhoven tiếp Feyenoord. Afellay đã có mặt trong độ hình xuất phát và gây ấn tượng với 2 bàn thắng.

Ngày 13 tháng 9, Afellay có trận đấu đầu tiên tại Champions League gặp câu lạc bộ Schalke 04. PSV đã giành chiến thắng với tỉ số 1–0. Ngày 8 tháng 10, HLV ĐT Hà Lan Marco van Basten đã gọi Afellay lên đội tuyển quốc gia trong các trận đấu gặp Cộng hòa Séc và Macedonia, mặc dù vậy anh không được thi đấu.

Ở mùa giải 2005–06, sau sự ra đi của các cầu thủ quan trọng như Johann Vogel và Mark van Bommel, Afellay dần được thi đấu thường xuyên trong đội hình chính, và thậm chí được lựa chọn trước cho ĐTQG Hà Lan. Anh chơi tổng cộng 23 trận trong mùa giải này và có 2 lần lập công. Số bàn thắng đó còn có thể tăng cao hơn nếu anh không gặp phải những chấn thương nhỏ trong cả mùa giải

Barcelona

Ngày 16 tháng 11 năm 2010, FC Barcelona và PSV Eindhoven đã đạt thỏa thuận về việc Afellay chuyển nhượng tới đội bóng xứ Catalan vào tháng 1 năm 2011. Afellay tới Barcelona ngày 23 tháng 12 năm 2010 để thực hiện kiểm tra y tế và hoàn thành hợp đồng. Mức phí chuyển nhượng được thông báo vào khoảng 3 triệu €.[2][3]

Afellay đã ký một bản hợp đồng có thời hạn tới năm 2015 với câu lạc bộ và mang áo đấu số 20.[4] Anh là cầu thủ người Hà Lan thứ 19 từng thi đấu cho Barcelona.[5] Afellay có trận đấu đầu tiên vào ngày 5 tháng 1 năm 2011 khi vào sân thay David Villa ở phút thứ 89 trong trận đấu Cúp Nhà vua Tây Ban Nha gặp Athletic de Bilbao. Afellay lần đầu có mặt trong đội hình xuất phát vào ngày 19 tháng 1 năm 2011 trong trận lượt về Cúp Nhà vua Tây Ban Nha gặp câu lạc bộ Real Betis. Trận đấu kết thúc với tỉ số 3-1 nghiêng về Real Betis nhưng Barca vẫn lọt vào vòng bán kết khi thắng với tổng tỉ số 6-3. Bàn thắng đầu tiên của anh cho Barcelona là trong trận gặp câu lạc bộ UD Almeria tại Cúp Nhà vua Tây Ban Nha vào tháng 2.[6]

Afellay có màn ra mắt cho Barça tại UEFA Champions League trong trận gặp Arsenal, và hai lần có cơ hội ghi bàn. Vào cuối giải đấu, Afellay được vào thay người ở phút 71 trong trận bán kết lượt đi UEFA Champions League gặp câu lạc bộ Real Madrid. Ở phút 76, anh đã kiến tạo cho Lionel Messi ghi bàn mở tỉ số và Barcelona đã vượt qua Madrid với tỉ số 2-0.[7] Anh ghi bàn thắng đầu tiên tại La Liga trong trận thắng 3–1 trên sân khách trước Málaga CF vào ngày cuối cùng của mùa giải 2010–11. Anh đồng thời cũng được vào sân thay người trong trận chung kết UEFA Champions League gặp Manchester United.

Afellay bị dính chân thương dây chằng đầu gối trong một buổi tập vào tháng 9 năm 2011[8] và phải ngồi ngoài hơn 7 tháng. Sau khi trải qua ca phẫu thuật, anh đã mất một thời gian dài để phục hồi và vào tháng 4 năm 2012 Afellay tuyên bố rằng anh đã sẵn sàng trở lại thi đấu[9]. Ngày 29 tháng 4, anh được vào sân ở phút thứ 71 thay cho người đồng đội Sergio Busquets trong trận đại thắng 7-0 trước Rayo Vallecano, dù phải thi đấu ở vị trí tiền vệ trung tâm,một vị trí không quen thuộc, nhưng anh vẫn gây được ấn tượng. Sau trận đấu, Afellay cho biết anh rất hạnh phúc khi quay trở lại, và anh có niềm tin vào huấn luyện viên mới của Barcelona - Tito Vilanova.

Stoke City

Afellay chính thức thi đấu tại Premier League với điểm đến là Stoke City vào ngày 27 tháng 7 năm 2015 theo bản hợp đồng có thời hạn hai năm.[10]